Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb3Q9R1P1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms