Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tpk1Q9R0M5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tpk1Q9R0M5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tpk1Q9R0M5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tpk1Q9R0M5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tpk1Q9R0M5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Tpk1Q9R0M5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Tpk1Q9R0M5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Tpk1Q9R0M5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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