Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms