Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms