Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms