Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms