Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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