Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TefQ9JLC6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TefQ9JLC6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TefQ9JLC6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TefQ9JLC6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TefQ9JLC6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TefQ9JLC6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TefQ9JLC6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TefQ9JLC6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TefQ9JLC6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TefQ9JLC6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TefQ9JLC6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TefQ9JLC6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TefQ9JLC6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TefQ9JLC6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TefQ9JLC6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms