Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin3Q9JLB9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin3Q9JLB9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin3Q9JLB9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin3Q9JLB9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin3Q9JLB9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin3Q9JLB9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin3Q9JLB9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin3Q9JLB9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin3Q9JLB9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin3Q9JLB9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin3Q9JLB9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin3Q9JLB9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms