Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms