Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms