Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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Cldn19Q9ET38 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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Cldn19Q9ET38 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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Cldn19Q9ET38 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Cldn19Q9ET38 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Cldn19Q9ET38 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Cldn19Q9ET38 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Cldn19Q9ET38 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Cldn19Q9ET38 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Cldn19Q9ET38 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms