Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Trim39Q9ESN2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Trim39Q9ESN2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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