Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms