Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx12Q9ER00 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms