Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQS3

Mycbp, c-Myc-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MycbpQ9EQS3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MycbpQ9EQS3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MycbpQ9EQS3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MycbpQ9EQS3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms