Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms