Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms