Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms