Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms