Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms