Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms