Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B2

Ttc25, Tetratricopeptide repeat protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc25Q9D4B2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc25Q9D4B2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc25Q9D4B2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms