Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nol3Q9D1X0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms