Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc167Q9D162 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms