Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shisa9Q9CZN4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms