Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim13Q9CYB0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim13Q9CYB0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms