Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl11Q9CXW4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms