Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms