Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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