Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms