Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms