Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
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Trim12aQ99PQ1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Trim12aQ99PQ1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Trim12aQ99PQ1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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