Protein–RNA interactions for Protein: Q99PD7

Slc24a3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc24a3Q99PD7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc24a3Q99PD7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms