Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Hdac9Q99N13 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Hdac9Q99N13 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac9Q99N13 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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