Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pacsin3Q99JB8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pacsin3Q99JB8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pacsin3Q99JB8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pacsin3Q99JB8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pacsin3Q99JB8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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