Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ophn1Q99J31 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms