Protein–RNA interactions for Protein: Q925E0

Sntg2, Gamma-2-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg2Q925E0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sntg2Q925E0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sntg2Q925E0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms