Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim59Q922Y2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms