Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpe65Q91ZQ5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpe65Q91ZQ5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms