Protein–RNA interactions for Protein: Q91V61

Sfxn3, Sideroflexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn3Q91V61 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms