Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps4aQ8VEJ9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps4aQ8VEJ9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms