Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE80

Thoc3, THO complex subunit 3, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc3Q8VE80 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Thoc3Q8VE80 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thoc3Q8VE80 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms