Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OptnQ8K3K8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms