Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms