Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB96

Rassf4, Ras association domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf4Q8CB96 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rassf4Q8CB96 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms