Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms