Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms