Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms