Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp37Q8C0R0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp37Q8C0R0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp37Q8C0R0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp37Q8C0R0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp37Q8C0R0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp37Q8C0R0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp37Q8C0R0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp37Q8C0R0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms